SA Kiusamisvaba Kooli juhatus on kaheliikmeline. Vastavalt 2. juuni 2015. aasta otsusele kuuluvad juhatusse tegevjuht Triin Toomesaar ja sisuekspert Kristiina Treial.

 
Nõukogusse kuuluvad 2. juunist 2015. aastal:

Ly Kasvandik (Perekeskus Sina ja Mina esindaja); nõukogu esimees alates 01.01.2017;
Rasmus Rask 
(sihtasutuse asutaja);
Kristi Liiva (sihtasutuse asutaja);
Külli Lilleorg (Heateo SA esindaja);
Koidu Tani-Jürisoo (Omanäolise Kooli Arendkeskuse esindaja).